岗位描述
【本岗位聚焦三个核心科研方向:】
◆ 三代测序数据分析(长读长测序/第三代基因组学)
◆ 单细胞转录组/空间转录组等测序数据分析(Single-cell / Spatial transcriptome)
◆ PGT数据分析(胚胎植入前遗传学检测 / 染色体非整倍体 / 单基因病)
职责
研究设计:独立承担科研课题,制定研究方案、实验设计及技术路线;参与科研项目申报(国家/省市博士后基金等)
算法开发:基于Python/R/Bash开发数据分析流程,运用Snakemake/Nextflow等工作流工具实现自动化;代码规范管理(Git)
数据管理:负责测序数据的存储、整理与版本管理;维护内部数据库及参考基因组注释资源;保障数据安全与隐私合规
成果产出:在国内外高水平期刊(SCI,影响因子≥5为佳)发表论文;申请相关专利;主导或参与技术报告撰写
产业转化:将科研成果转化为可落地的产品算法或检测方案;配合产品团队完成技术文档与注册资料准备
团队协作:与实验室、临床、产品、市场部门协同开展跨学科合作;指导或带领初级研究人员、实习生
对外交流:参加国内外学术会议并汇报成果;承担部分高校/院所合作课题的对接与沟通工作
【专业技能要求】
编程语言:Python(必须)、R(必须)、Bash/Shell(必须);熟悉Nextflow / Snakemake者优先
三代测序工具:Minimap2、PBMM2、pbsv、Sniffles、CANU/Hifiasm/Flye组装工具中至少掌握2种
单细胞分析框架:Seurat / Scanpy(至少1个),熟悉Harmony/Scanorama整合、MACS2/ArchR(ATAC方向)
遗传变异分析:GATK / DeepVariant / CNVnator / LUMPY;熟悉CNV/LOH/嵌合体分析;了解单倍型分型方法 PGT方向
统计与机器学习:掌握贝叶斯统计、回归模型;sklearn/TensorFlow/PyTorch用于序列数据特征学习加分
高性能计算环境:熟悉Linux集群操作(PBS/SLURM任务调度);了解Docker/Singularity容器化部署
人工智能的应用:熟悉主流人工智能工具,并将人工智能工具广泛用于生物信息开发过程。
【能力素质要求】
◆ 科研独立性:能够独立提出科学问题、设计研究方案并推动实施,具备较强的自驱力
◆ 文献研读:持续追踪领域最新进展(bioRxiv、Nature Methods、Genome Research等),并将方法快速内化应用
◆ 跨界沟通:能将复杂的生物信息学分析结果向临床医生、产品经理等非技术人员清晰传递
◆ 英语能力:能够流利阅读英文文献;具备英文写作和口头汇报能力(参会投稿需要)
◆ 项目管理:能合理规划研究节点,按时交付阶段性成果,适应产学研结合的工作节奏