岗位描述
岗位职责
1.跟踪蛋白质工程、抗体设计等领域的研究动态,评估和改进in silico抗体设计优化平台
2.负责大分子(蛋白质、抗体、多肽、核酸等)及其复合物体系的全原子/粗粒化分子动力学模拟,解析构象变化、稳定性及相互作用机制。
3.负责抗原-抗体复合物进行建模及能量优化等计算设计,对抗体序列和结构进行改造,与实验团队协作完成候选抗体的筛选与优化;
4.评估抗体的稳定性和聚集性倾向,指导抗体的序列和结构优化;
5.跟踪蛋白质工程、抗体设计等领域的研究动态;负责大分子设计计算平台的搭建、改进、升级与维护(包括大分子数据库构建、计算流程自动化等),提升抗体设计的效率和成功率;
6.与实验部门紧密合作,为生物大分子药物的发现及优化提供计算模拟支持。
岗位要求
1.硕士及以上学历,计算生物学、计算化学、生物物理学相关专业,具备扎实的蛋白质结构、统计力学与分子模拟理论基础;
2.熟练掌握至少一种主流分子动力学模拟软件(如 GROMACS、Amber、OpenMM),熟悉蛋白质结构建模、分子对接及自由能计算相关工具(如 Rosetta、HMMER、Discovery Studio等);
3.熟练掌握Python、Bash、C/C++等编程语言,精通Unix/Linux操作系统,能够进行脚本编写、批处理及自动化流程搭建;
4.熟悉掌握AlphaFold、ProteinMPNN、ESM等蛋白质结构模拟和设计等AI工具;
5.能够独立设计计算方案并分析结果,具备良好的团队协作与沟通能力;
6.有机器学习/深度学习、抗体工程改造或蛋白质设计相关工作经验者优先。